Главными видами деятельности ИСОА являются: системный анализ внутриполитической ситуации; анализ макроэкономических процессов и программ экономического развития страны; анализ инвестиционной политики государства; мониторинг, оценка и анализ социально-политической ситуации в стране; анализ геостратегических и военных аспектов безопасности России; системный анализ геополитических процессов и внешней политики России; анализ системы международной безопасности и исследование тенденций ее мирового развития; анализ современного состояния информационной сферы, тенденций ее развития; анализ международно-правовых аспектов создания информационной инфраструктуры и обеспечения ее безопасности; проектная, научно-исследовательская деятельность, проведение технических, технико-экономических и иных экспертиз и консультаций; оказание консультационных и информационно-аналитических услуг; оказание содействия в подготовке экономической и иной документации, в проведении переговоров, заключении контрактов